Su misión es velar, de acuerdo con la ley, por el cumplimiento de las normas médico legales en materias de seguridad social; actuar como garante de la fé pública en la certificación de estados de salud y en la gestión de procesos técnicos y administrativos; garantizar en forma eficaz el acceso a los beneficios de la protección social en salud.

Las principales funciones de este departamento son:

• Aplicar las medidas conducentes a favorecer la eficiencia, objetividad, responsabilidad pública y calidad de la gestión.
• Proponer e implementar un diseño institucional básico y lineamientos normativos
• Fiscalizar, controlar y coordinar la gestión.
• Realizar auditorías, control y apoyo.
• Regular, fiscalizar y coordinar el cumplimiento de la normativa de seguridad social, en el ámbito de competencia del sector salud.
• Asegurar la claidad y agilización de los trámites.
• Asegurar una pesquisa oportuna y un adecuado acceso a los mecanismos de compensación social, en el marco del sistema de protección social de competencia del sector salud.
• Establecer directrices generales en el ámbito de competencia del sector salud en materias de seguridad social.
• Crear sistemas de registros de datos y optimizar los sistemas existentes.

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