Hasta 1990, el SIDA fue abordado como una área más del programa de las Enfermedades de Transmisión Sexual (ETS) del Ministerio de Salud. El nuevo gobierno decidió enfrentar el tema SIDA en su especificidad y complejidad, e implementó una Comisión Permanente Intersectorial, encargada de fijar las políticas al respecto, integrada por los subsecretarios de Salud, Interior, General de Gobierno, Educación, Justicia, Planificación y Cooperación, Trabajo y Previsión Social, de Carabineros e Investigaciones.

La Comisión Nacional del SIDA, CONASIDA -creada el 4 de mayo de 1990 y presidida por el Subsecretario de Salud-, responsable de la elaboración y coordinación ejecutiva del Programa de Prevención y Control del SIDA y, desde 1997,también de las ETS . CONASIDA promueve y facilita procesos orientados a que la sociedad asuma la prevención y la disminución del impacto biosicosocial del VIH/SIDA y las ETS.

Todo lo anterior lo realiza de acuerdo a:

• Las políticas de Salud vigentes y los criterios y recomendaciones de los organismos técnicos internacionales (Organización Mundial de la Salud, OMS; Programa Conjunto de Naciones Unidas para el SIDA, ONUSIDA, etc.).
• Los principios políticos del Gobierno sobre participación, descentralización, equidad, intersectorialidad y una cultura centrada en las personas.

Los principios éticos del derecho a la vida, la decisión en conciencia libre e informada, la privacidad y la confidencialidad; respeto por los valores, creencias y dignidad de las personas; defensa de la solidaridad y rechazo a la discriminación.